基督教在它的传播过程中，分化流衍，终于在公元1054年分成东西两大流派，即东正教和西正教。在早期基督教史上，地中海东部的国家拥有丰富的古代文化和较多的人口，而西部欧洲国家，只是罗马的属地，属半开放的区域。罗马帝国瓦解后的“黑暗时期”，欧洲东部才是基督教的中心所在。可是东正教不象西部的罗马天主教，是在教皇的名义下统一而有组织的，而权力始终是分散的。东正教在公元3世纪时，开始传到巴尔干半岛，到了10世纪才传入俄国。它传播的路线大致是沿着古代贸易的通道。到俄国是经黑海过来的。东正教有不少的支流，其中最大的分支是希腊正教和俄罗斯正教，以及欧洲东南部国家如罗马尼亚和保加利亚等国家的正教，颇富有国家主义的色彩。另有一支极具国家意识的正教是埃及正教，现留存于非洲的埃塞俄比亚的高原上。还有一支来自于7世纪的闪米特人的后裔，现存于黎巴嫩。东正教的传播颇受伊斯兰教的阻扰。土耳其的阿德曼（Ottoman）在1453年占据了君士坦丁堡，东正教的传播自然大受影响。俄国沙皇时代，在莫斯科的教廷上东正教是极具权威的，可是到了1917年俄国十月革命以后，东正教就一蹶不振了。随着东欧居民的移民美国，东正教也随之传入美国，因有各国国家主义的色彩，而有各种不同的派别。
西正教也称罗马天主教。自中世纪罗马帝国瓦解以后，皇帝的权力就落入教皇的手中。起先罗马天主教只限于欧洲南部的意大利、西班牙和葡萄牙所在的伊比利亚半岛和法国。以后逐渐为德国人和英国的凯尔特族人所信仰，而将教区从西欧扩大到中欧。当罗马天主教向欧洲北部推进的时候，南部的伊比利亚基地却被伊斯兰教所侵占。时间自公元700年一直到1500年。以后天主教又在原地复兴，再次盛行，以后葡萄牙人又将天主基督教教义传到非洲沿岸，甚至传到印度。等到西班牙人和葡萄牙人殖民中南美洲，天主教也就随之传入，同时也传播到南亚和东亚。在菲律宾群岛上，西班牙的传教士努力工作，使其地成为天主教的基地。到了19世纪，天主教在非洲、南亚和东亚都十分活跃。
上面提及西正教或罗马天主教是统一而且有组织的，可是到了12世纪以后，欧洲社会的经济与政治都起着变化，旧的教义不能适应新的社会变化，各种运动与改革的呼声从各地传来，终于在1500年，西正教分裂成两大教派：即原来的罗马天主教和新产生的所谓新教。天主教仍旧是坚强的统一的，而新教则四分五裂。在地域的分布上，新教限于莱茵河与多瑙河以北的地区，包括英国、德国北部、波罗的海沿岸及丹麦、瑞典、挪威和芬兰等地。