北港妈祖庙建于清康熙三十三年，奉祀天上圣母。相传当年福建莆田县湄州岛的朝天阁，有一位僧人捧天上圣母的神像来台，路经北港而为当地居民建小祠供奉。初时结茅为庙，清雍正年间改为木层砖瓦建筑，初现庙貌。后经乾隆十六年、三十六年和咸丰五年的扩建，庙宇略具规模。但在清光绪年间因北港火灾和地震，建筑几乎全部焚毁。从光绪三十四年再重修扩建，地方人士遂发起募捐，大兴土木，动工重建，从开工到宣统三年竣工，历时4年。这次重建工程浩大，庙宇占地2000平方米，除正殿外，前有毓麟宫，后有双公庙，左有聚奎阁、右有凌虚殿、庙西是文昌庙、东为三界公祠等等，形成庞大而严整的建筑群。
朝天宫地临北港溪右岸，庙宇为仿古宫殿。各殿都坐北朝南，正面宽约40米，里进深约56米。正殿为全庙最重要的建筑，殿前建拜亭，白石砌地，脊尾高翘凌空，屋脊装饰有飞龙、凤凰、麒麟、宝塔以及各种花草图案，是台湾寺庙传统的风格。大殿内供奉“天上圣母”，又名“镇殿妈”、“湄州妈”(实际均指天纪，即妈祖)，还有30尊妈祖的“分身”。“天上圣母”两侧有千里眼、顺风耳二神像。大殿东西两厢分别祀福德正神和主生娘娘。朝天宫的后殿主祀妈祖的父母兄姐，表示妈祖一家皆神，团聚一堂，此为台湾通俗佛教“人情味”的典型例子。
妈祖，姓林名默，福建莆田县湄州人，是著名的海上自然神。据历史记载，妈祖诞生于公元960年，逝世于987年，死时年仅28岁。传说妈祖正直性善，勇敢聪慧，以在惊涛骇浪中解救人出名。从宋代至清代，无论是官员出使外国，进行海上运输，还是渔民扬帆打渔，商人从事海上贸易，往往都要先行祭祀妈祖，祈求神灵保佑，在船舶上还设立妈祖神位，时时供奉。至今这一遗俗仍在沿海的民间流行。
在台湾还有许多的妈祖庙。在基隆市忠工路有一座安庆宫，又名鸡笼妈祖庙。创建于清嘉庆十九年，由福建漳州移民为祈求河清海晏、安居乐业而建，内奉妈祖神像。大天后宫，在台南市妈祖宫街，又名台南妈祖庙。清康熙二十二年，由明宁靖王朱术柱宅改建而成。殿内供奉着妈祖神像、两旁立千里眼和顺风耳二神。庙内尚保存有建庙、重修的石碑数块。坐落在台东县台东镇的台东天后宫，又名台东妈祖庙。始建于清光绪十五年，光绪皇帝亲敕“灵昭诚佑”匾额一面。门前有龙柱石狮，雕工颇为精细。澎湖天后宫在澎湖岛的张公镇，又名澎湖妈祖庙。相传明万历三十一年已有，为台湾全省最古老的庙宇之一。天后宫于公元1919年重修。鹿港妈祖庙最具特色，仅鹿港一处就有3座妈祖庙，妈祖庙之多，是台湾其他地方所罕见的，这3座妈祖庙是旧祖庙，新祖庙和兴化妈祖庙。鹿港的旧妈祖庙创建于明末永历元年，、这是台湾早期建造的妈祖庙之一，历经300多年，几经修缮扩建，如今的旧妈祖宫，庄严肃穆，被称为鹿港3大古迹之一。
台湾人笃信妈祖，她既是航海保护神，又是年岁丰收和保境安民的象征。每年农历1—3月，在台湾各地的妈祖庙进香的人络绎不绝；而农历3月23日妈祖诞辰前后，香客更多。