湿地生态系统通常处于陆地生态系统和水生生态系统之间的过渡区域，一般由湿生、沼生和水生植被、动物、微生物等生物因子和阳光、水分、土壤等非生物因子所构成。
其生物部分包括生产者、消费者和分解者，它们之间通过物质循环和能量流动而相互联系和相互制约。 分解者的种类和数量均较少，且以厌氧微生物为主，有机体残体分解不完全。消费者主要是喜湿鸟类尤其是水鸟和鱼类，底栖无脊椎动物、昆虫、两栖动物、爬行动物亦较常见，哺乳动物种类和数量较少，生产者则具有特殊的适应特征。
二、湿地生态系统现状
湿地是地球上最重要的生态系统类型之一，全球湿地面积为570万平方公里，约占陆地面积的6.4%。我国湿地面积在不计鱼塘和河流的情况下约为6594万公顷，近年由于退耕还湖政策的实施，因此现在实际的湿地面积应该远远超过上述数字。
三、湿地生态系统功能特点
过渡性：湿地生态系统介于陆地生态系统和水生生态系统之间的过渡类型，既有适应陆地生活的生物种类，又有适应水生生活的种类，兼有适应水陆生活的种类，这种位于水陆交界面的物种组成的交错带，使湿地生态系统具有显著的边缘效应，这是湿地生态系统具有很高的生产力和生物多样性的基本原因。
高生产力：湿地生态系统是地球上具有较高生产力的生态系统之一。湿地对水的开放程度是其初级生产力的最重要的决定因素，因为水流是营养物质进入湿地生态系统的主要渠道。必须指出的是，并不是所有的湿地生态系统都具有高的生产力。
多样性：湿地生态系统类型和生物种类极其丰富多样，是天然的基因库，在保护物种多样性方面具有重要意义。
脆弱性：由于湿地生态系统处于水陆交界的生态脆弱带，很容易受到自然和人类的干扰，生态平衡很容易受到破坏，而一旦受到破坏，就很难恢复。