内乡县衙始建于元朝大德八年(公元1304年)，现存建筑是清光绪十八年(公元1892年)五品知县章炳焘重建的。知县一般是“七品芝麻官”，而章炳焘为五品，所以县衙也修得特别气派。
内乡县衙占地27000平方米，共有房屋280间。整座县衙坐北朝南，中轴线上有宣化牌、大门、仪门、大堂、重光门、琴治堂、迎宾厅、三堂、金库、樵楼等，主要建筑分大堂、二堂、三堂三部分，基本上保存了原有风貌。
大堂即正堂，巍峨森严，是县太爷审理大案要案、宣判死刑、迎接圣旨、举行盛大典礼的地方。堂高11.2米，面阔5间，建筑面积284平方米。门楣正中挂一块金字匾额，上书“内乡县衙正堂”6个大字。大堂中心，是知县审案的“暖阁”，“三尺法案”端放于暖阁内高台上，上面放置惊堂木、文房四室、官印及令箭。正面屏风上绘有“海水朝日图”。暖阁顶棚绘有36个方格，象征360天，每个方格中都有一只仙鹤展翅飞向中心，中间画有八封图，象征周天子划天下为方圆。大堂前柱子上有一副对联：“欺人如欺天毋自欺也，负民即负国何忍负之”。这是南宋名臣文天祥作扬州县令时所写的对联。大堂中至今仍镶嵌着两块明万历年间的跪石．左为原告石，右为被告石。几百年来，石头上竞被双膝磨出了凹痕。暖阁左右排列着十八般兵器、男女各异的刑具及“肃静”、“回避”两对高大木牌。大堂外木架上高擎一面大鼓，是专为告状人设置的。
二堂也叫琴治堂，堂上设公案。两侧各有配房5间，中间是过厅，可达东西花厅院。二堂是处理民事案件的地方。三堂也称公署院，是县令接待上级官员和商议政事的地方。
内乡县衙内开阔幽静，肃穆庄严，兼备长江南北的建筑风格。院内有古树2株，一株为桂花树，另一株为南天竹。衙内还保存有大量珍贵文物。一张元代长条桌案长3米，高60厘米，刻有花纹，是元天历三年制造的。明万历三十九年知县易三才等人立于公署大门的“三院禁约”碑，上刻4条禁约，其中有邮政方面的禁规，是研究明代邮传史不可多得的文字资料。另外这里还珍藏着慈僖太后和光绪皇帝的彩色画像，咸丰皇帝的圣旨，宣讲圣谕广训的招牌等。
1985年底，经文化部、国家文物局批准，这里建立了全国唯一的县衙博物馆--内乡县衙博物馆。