1938 年国民党政府在郑州附近的花园口炸开黄河南堤，造成黄河又一次严重侵淮，到1947 年方才堵复。黄河洪水泛滥面积达5 万余平方公里，在颍、涡河之间，豫皖两省有2 万余平方公里的土地遭泥沙淤积，成为荒无人烟的黄泛区。淮河流域的洪、涝、旱灾频繁。从公元1400～1900 年，共发生较大水灾350 次，较大旱灾280 次，形成“大雨大灾，小雨小灾，无雨旱灾”的困境。
治淮成就20 世纪30 年代初，导淮委员会、江苏省先后整治了张福河与淮阴以下的废黄河，开挖了七套到套子口间的中山河，整修了淮河干流中游及苏北京杭运河堤防，疏浚了运河浅滩，修建了刘老涧及淮阴100 吨级船闸等工程。1949 年以来，首先进行了沂、沭河的治理工程，开挖了新沭河和新沂河，使泗、沂、沭河洪水有了出路。1950 年起开始全面治淮，根据中央关于“根治淮河”的决定，明确了“蓄泄兼筹”的治淮方针，并成立了治淮委员会。1951、1956、1971 年先后进行了三次治淮规划。规划内容以防洪、除涝、灌溉为主，并包括水土保持、水力发电、航运等方面。50 年代以来，在山地丘陵区修建了大中小型水库5300 多座，其中大型水库35 座，中型水库150 座，总库容250 亿立方米。较大的大型水库有安徽的响洪甸、梅山、佛子岭（见佛子岭水库），河南的南湾、鲇鱼山、薄山、宿鸭湖、昭平台、白龟山，山东的岸堤、跋山，江苏的石梁河等。在平原地区利用湖泊、洼地修建蓄洪滞洪区十余处，总库容280 亿立方米。较大的湖洼蓄洪区有安徽的濛洼、城西湖、城东湖、瓦埠湖，江苏的洪泽湖、骆马湖，山东的南四湖等。扩大下游地区入江入海出路，淮、泗、沂、沭下游的泄洪能力从原来的0.9万立方米/秒，增加到2.7 万立方米/秒。其中主要的有新沭河、新沂河、苏北灌溉总渠和入江水道。加高加固干支流堤防1.5 万公里；新挖骨干河道十余条，其中较大的有漴潼河、堤上的三河口，直泻白马、宝应、高邮、邵伯诸湖，经江都县六闸穿里运河，过归江坝，出运盐、金湾、太平、凤凰、新河、壁虎等6 条河，穿古运盐河归并为廖家沟和芒稻河入沙头河（即小夹江），于三江营入长江，正式形成了入江水道，排泄淮河全部洪水。1949 年前入江水道残破，汛期常溃决淹没里下河低平原。1953 年建成了控制入江水道进口的三河闸。以后又配合江都水利枢纽的建设，陆续全面整治入江水道，使入江水道的排洪流量由原来的8000 立方米/秒提高到1.2 万立方米/秒，但在特大洪水到来时仍难以安全泄洪。