澎湖列岛中心马公市港口。位于澎湖岛西部， 马公湾北岸。马公本名“妈宫”，以妈祖宫（天后宫）得名，庙建于明天启 四年（1624）。清光绪十三年（1887）于其地筑妈宫城，1889 年竣工，至今 仅城门遗址保存完整。日本侵据台湾后，改名“马公”。为台湾省著名港湾 之一，宋、元以来，已是中国海防要区和台湾海峡渔业基地。马公港南侧有 风柜尾半岛环抱，港口向西北，与澎湖湾通连，港内有测天岛，与马公港市 街南北相望。马公港的商港、渔港分别在马公市街南及东南侧，商港水深 6.5～10.5 米，水域约 6 万平方米，可供 3000 吨级船只进出；渔港分第一、 第二渔港。海军基地在测天岛。
马公港主要商业活动仅限于粮食进口和水产 出口。历史上马公港与台南安平港的关系最密切，现安平港地位已为高雄港 所取代，自马公至高雄 79 海里，至厦门 103 海里。