（二）明确自然保护区评价的准绳
随着新的保护区不断提出，也会带来一系列新的问题。例如怎样来判别自然保护区的保护价值？根据什么来决定保护区的取舍？如何确定自然保护区的等级等。为了解决这些问题，必须对自然保护区的评价提出一定的准绳。由于自然保护区类型的多样性和条件的复杂性，要提出一个统一的模式还有一定的困难，通常都是采用一系列指标进行综合的分析和判断。在这方面，最常用的指标有以下几个。
1.典型性或代表性
这是指自然保护区的对象对于所要保护的那种类型是否有代表性。这一标准对于作为保护典型的生态系统的保护区来说尤为重要。通常在保留有原始植被的地区，保护区最好能包括对本区气候带最有代表性的生态系统，从群落地理学的观点来说，即应设在有地带性植被的地域，它应包括本地区原始的“顶极群落”（稳定群落）。如果原始的生态系统遭到破坏，则保护区应选择在具有代表性的次生的生态系统中。
2.稀有性
对于很多自然保护区来说，保护稀有的动植物种类及其群体，是一个重要的任务。如果某些自然保护区集中了一些其它地区已经绝迹的、残留下来的孑遗生物种类，就会提高自然保护区的价值。特别是中国南方有些地区，由于特殊的山地地形和温暖湿润的季风气候，没有受到第四纪冰川的严重破坏，有些地区还汇集了一群稀有的物种，形成了所谓第三纪动植物的“避难所”。在这种区建立自然保护区有着特别重要的意义。
3.脆弱性
脆弱性是指所保护的对象对环境改变的敏感程度。脆弱的生态系统往往与脆弱的生境相联系，并具有很高的保护价值。但是它们的保护比较困难，要求特殊的管理。
4.多样性
保护区中种群的数量和群落的类型是保护区的又一重要属性。一般说来，种类数量愈多，即多样性程度高的类型，其保护价值愈大。这一指标主要取决于立地条件的多样性以及植被发生的历史因素。如果保护区中能包括一定的生态序列的各种生物类型的组合，例如垂直带系列，随着距海滨的远近而发生的生物群落的空间变化序列，由于植被发育时间的差异和人为干扰造成的生物群落的演替系列，以及由于局部地区的小气候、地形、坡向、坡位、母岩、土壤、土地利用和生产实践上的区别所造成的多种多样的生物群落，则最为理想。
5.面积的大小
有些地区由于人为破坏严重，一个保护区的重要性经常随面积的增加而提高。一个自然保护区必须满足维持保护对象所需的最小面积。保护区的最小或最适面积，因保护对象的特征和生物群落类型的不同而有差异。
6.天然性
习惯上用天然性来表示植被或立地未受人类影响的程度。这种特性对于建立科学研究目的的保护区或是核心区，有特别重要的意义。有的保护区既包括天然的，又包括半天然的部分，也是非常理想的。特别是一个具有天然性的保护区，同时又具有稀有性和脆弱性的特点时，则会显著提高其保护价值。
7.感染力
感染力是指保护对象对人们的感观所产生的美感的程度。虽然从经济观点来看，不同物种具有不同的利用价值，但是由于人类科学的发展和认识的深化，许多动植物正在发现新的经济价值。同时，由于不同种类的物种和生物类型是不可代替的，因此从科学的观点来说，很难断言哪一种类型和物种更为重要。但是由于人类的感觉和偏见，不同的有机体具有不同的感染力。例如，对大多数人来说，大熊猫就比某些蜘蛛或甲虫更为重要，即使后者具有更加古老的发生历史和稀有程度。这一标准，对选择风景保护区来说尤为重要。
8.潜在的保护价值
有些地域一度曾有很好的自然环境，但由于各种原因遭到了干扰和破坏，如森林受到采伐和火烧，草原经过了开垦或放牧，沼泽进行了排水等。在这种情况下，如能进行适当的人工管理或通过天然的改变，生态系统过去的面貌可以得到恢复，有可能发展成比现在价值更高的保护区。当我们找不到原有的高质量的保护区时，这种有潜在价值的地域，也可以被选作自然保护区。
9.科研的基地
包括一个地区的科研历史、科研的基础和进行科研的潜在价值。上述9 个评价自然保护区的标准，有时是互相交叉、互为补充的，例如一个具有代表性的保护区，同时又可能具有多样性、天然性，并具有足够的面积和科研价值，从而增加其保护等级。但也有些标准则往往互相矛盾，相互排斥。例如一个稀有的保护对象往往很难具有典型性或代表性的特征。因此，应用上述评价自然保护区的标准，是一个十分复杂的问题。在运用这些标准进行评价时，必须和自然保护区的目的结合起来。对于一般的自然保护区来说，典型性、稀有性和脆弱性具有特别重要的意义。有些标准可以独立使用，有些标准要结合起来用。一个保护区要想列为高等级的自然保护区，必须考虑综合因子，而其中必有一个或几个因子占主导地位。
通过上述标准的综合分析，将自然保护区分别列入不同的等级。对那些具有特别重要的保护价值，不仅在国内、同时在国际上也具有重大影响和意义的保护区，应列为国家级的重点保护区，并申请纳入联合国教科文组织国际生物圈保护区网或世界遗产地。