1.红壤地区水稻土
红壤地区水稻土主要分布于中国中亚热带、南亚热带和热带。位于中亚热带的水稻土一般为一年两熟，除山区海拔较高的地方种植一季中稻或晚稻外，在盆地和滨海平原普遍种植双季稻。稻田全年淹水时间210 天左右。位于南亚热带和热带地区的水稻土，由于年平均气温在22℃以上，降水量大于1400 毫米，无霜期很长，甚至终年无霜，因此一年可三熟。红壤地区水稻土的理化特性，主要表现为铁、锰的淋溶淀积现象十分强烈；有机质积累作用较明显，含量较高（1.5～2.5％）。由于起源土壤富铝化，所以水稻土胶体部分硅铝率也多在2.2 以下。土壤的阳离子交换量低，盐基不饱和，pH 在5.0～6.5 间。处于水耕熟化初期的土壤，矿质养分不丰富；而高度熟化的水稻土则必然具有良好的物理性质和丰富的养分。由紫色土起源的水稻土，铁、锰淋淀作用微弱，土壤一般呈中性至微碱性反应，盐基饱和，矿质营养元素含量丰富。由石灰岩母质土壤起源的水稻土，因受富含重碳酸钙灌溉水和过量施用石灰的影响，常使碳酸钙在剖面上部聚积，犁底层出现石灰结核，形成石灰板结层，耕性很差。
2.黄棕壤地区水稻土
秦岭、淮河以南，长江中下游北亚热带黄棕壤地区的水稻土，一年多为稻、麦两熟，也有种双季稻的。冬作物主要是小麦、油菜或绿肥。稻田淹水时间为160～190 天。在水旱轮作制度下，有机质的分解作用较红壤地区水稻土强，含量一般不超过2.0％。还原淋溶程度也较弱，铁、锰在剖面中呈斑纹状，结核状的很少见。在肥沃水稻土中，耕层下部结构面上常见有鲜红色的铁的有机络合物，群众称为“鳝血”，可作为该区水稻土高度熟化的标志。这里的水稻土，主要起源于黄棕壤以及河湖沉积物上的草甸土和沼泽土。土壤多呈中性反应，pH6.5～7.5，盐基饱和。土壤胶体部分的硅铝率较红壤地区水稻土高，为2.5～3.4。阳离子交换量为15～20 毫克当量/100 克土，保肥性能好。矿物养分含量也较高。
3.北方地区水稻土
秦岭、淮河以北暖温带和温带地区的水稻土，为一年一季稻，也有进行隔年水旱轮作的。起源土壤主要是草甸土、沼泽土、白浆土和草甸黑土。该区由于年降水量低，所以水稻土主要分布于江河流域低洼地、河谷盆地，以利灌溉。因冬季气温低，土壤冻结期较长，故土壤有机质分解缓慢，含量较高。剖面中物质的淋溶淀积作用也较弱，铁、锰分异现象不太明显，因此，起源土壤的特点保留较多一些。土壤多呈中性和微碱性反应，pH7.0～8.0。