第四纪虽然已形成现代全球构造和地理面貌，但新构造运动却在时时刻刻改变和塑造着新的面貌。在海洋中大洋中脊不断向外扩张，如太平洋板块中脊两侧，每年向东移动6.6cm，向西移动最大可达11cm。近年中日两国科学家发现，日本列岛与中国大陆之间的地理距离在逐年靠近，日本茨城县鹿岛町与中国上海市的距离每年缩短2.9cm。美国全球定位系统卫星（1994）提供的数据显示，澳大利亚大陆正在以每年5—8cm 的速度朝着北东方向缓慢移动。又如喜马拉雅山和青藏高原，虽然在喜马拉雅运动期间即已隆起，但是第四纪以来上升速度和幅度急剧增大。以希夏邦马峰为例，晚第三纪在2000 多万年中上升了2000 多m，而在第四纪200 万年中却上升了3000 多m，比起晚第三纪上升速度快了10 几倍。地质学家考察认为珠穆朗玛峰还在继续增高，年平均增高1cm。说明和欧亚大陆和印度岩石圈板块之间的缓慢而又极强的撞击，仍在起着力拔千钧的作用。青藏高原在第四纪迅猛隆起，对于自然地理和气候状态起着不可估量的作用。例如，在喜马拉雅山南麓的印度西瓦里克群地层（上新统）中产三趾马化石，而且可以据此与山的北麓以及中国北部的三趾马化石互相对比，说明在上新世时南北环境差别不大，喜马拉雅山和青藏高原在当时还没有成为动物活动或迁徙的障碍。但是从当前看，三趾马化石产地海拔高度相差非常悬殊，如在藏南为4300m，藏北唐古拉山为4000m，兰州为1000m，山西为500—700m，华北平原在海面下320m（钻孔中）。这足以说明中国目前这种西（南）高东低、百川东流的形势是在第四纪中完成的。
青藏高原的隆起对于全球气候的变化，更具有显著影响。美国W.拉迪曼和M.雷莫（1989）认为：大约在4000 万至5500 万年以前（相当早第三纪始新世），那时全球的气温相对平稳，比较暖和。随着高原渐渐升起，大气循环和风向都发生了变化，从而形成今天北半球格局迥异的植被组成情况。并且，西藏高原的隆起导致了这个地区季风的形成。高原上空聚集的热空气不断上升，并且由于印度洋海面上吹来的湿润凉爽空气因此发生位移，从而造成了每年的雨季。正是这些降雨，带走了空气中大量的CO2，含有CO2 的降水与裸露岩石发生反应，加促岩石风化，所溶解的碳酸钙物质经河流流入海洋，于是具有硬壳的海生动物便有了取之不尽的食物来源。而最终这些物质将沉积海底，形成石灰岩。虽然西藏高原和喜马拉雅山只占全球陆地面积的5％，但是流入全球海洋中的沉积物几乎有25％来自这个地区。拉迪曼和雷莫认为：大气中CO2 大量减少，致使全球气温变低。今天地球的气温比5000万年前低12—15℃。他们的这种西藏高原隆起和大气中CO2 日益稀薄论曾引起一定的反响。
由于板块的碰撞和俯冲，不仅导致青藏高原的隆起，而且导致大陆内部断裂运动的增加，如天山和祁连山都因断裂而产生差异性升降运动，上升部分形成高山，高山之间则形成断陷河谷或盆地，如天山西北部赛里木湖便是上升山块中的下陷洼地。许多早期的断块山地，如长江下游的庐山和九华山，华北平原上的泰山，在第四纪也都继续上升，而松辽平原、华北平原等也在继续下沉，反映了新构造运动的继承性特点。