中国东海的一部分，沿海南北海上交通 要冲，闽、台两省间交通要道。海峡北界从福建平潭岛到台湾富贵角，相距 约 93 海里；南界从福建东山岛到台湾最南端鹅銮鼻，宽约 200 海里。海峡为 大陆架浅海，大部分水深不及百米，近 3/4 水域水深不及 60 米，东南部水深 达 140～150 米，并以 40～50％的急坡进入南海海盆。
海峡海底地形较复杂，有海底阶地、海底峡谷、岩滩、浅滩、海沟和海 底港湾等多种类型。两级海底阶地水深分别为 20 米和 40～50 米，分布于海 峡两侧。两级阶地上横切数条北西向峡谷，分布于闽江、木兰溪和九龙江等 口外，此即第四纪冰期海面下降时上述诸河向外延伸的河段。岩滩分布在澎 湖列岛四周，为玄武岩台地，出露在海面的即为澎湖列岛。台湾浅滩位于东 海与南海交界处，水深很小，最浅处水深仅 10 米。浅滩向东北延伸，与澎湖 岩滩相连；向西北与水深 40～50 米的海底阶地相接，形成海底陆桥，当第四 纪冰期海面数度下降时，成为大陆动物迁移台湾的通道。浅滩上分布有沙丘 926 个，多呈北东向排列，景观独特。海沟有二：一称澎湖海沟，位于澎湖 列岛与台湾西岸之间，呈南北走向，长约 70 公里，深达百余米；另一位于澎 湖列岛中部，呈东西向，深 70 米，成为妈宫港的天然航道。海底港湾位于海 峡的东南部，港口向南，水深 185～740 米。
海峡水主要由浙闽沿岸水、南海水和黑潮水 3 种不同性质的海水组成。 它们在不同季节的交替作用，对海峡的气侯，特别是气温影响很大。海峡的 气候大体与福建沿海相似，冬半年受大陆频频入侵的冷空气影响，夏半年受 热带天气系统的控制，加之狭管效应，风力特别强劲，使海峡具有明显的季 风气候特征。其特点是冬季受西伯利亚或蒙古冷气流的影响，盛行东北季风， 平均风速大，大风日数多，盛行期长；夏季盛行西南风，平均风速小，大风 日数少；春秋两季为季风交换季节。
台风是影响海峡夏、秋季天气的重要因 素，从 5～11 月，特别是 7～9 月，台风经过海峡时，狂风和暴风雨常造成严 重灾害。 台湾海峡是亚热带浅海，水温较高，终年水温变动在 9.7～26.6℃。海 峡的海水盐度，冬季为 30.1～31·4％，夏季为 32.5～33.8％。台湾海峡是 中国的重要渔场，海洋鱼类品种约 700 余种，其中经济鱼类有百余种。台湾 海峡两岸有较丰富的砂矿。台湾西岸近海已发现有海底石油。