贵州梵净山国家级自然保护区位于贵州省东北部的江口、松桃、印江三县交界处，保护区地理坐标为东经108°45′55″～108°48′30″，北纬27°49′50″～28°1′30″。保护区总面积4.19万公顷，1978年确定为国家级自然保护区。保护区主要以亚热带森林生态系统及黔金丝猴、珙桐等珍稀动植物为保护对象。
梵净山山体庞大，地势高耸，最高峰凤凰山海拔2572米，金顶海拔2493米，而东坡山麓的盘溪口海拔仅500米，高差达2000余米。以凤凰山、金顶的峡谷地形为中心，四周逐层散布低中山，低山和丘陵等各种地貌类型。
梵净山地区属东亚季风气候区，具有明显的中亚热带季风山地湿润气候特征。年均温介于5.0～17.0°C，相差达12°C之多，气温随地势增高而降低。年降水量介于1100～2600毫米之间，是贵州省降雨量最多的地区，也是全国多雨地区之一。相对湿度年均80%以上，气候垂直变化多样，形成气象万千的气候特征。具有典型的中亚热带季风山地湿润气候特征。
梵净山为乌江与沅江水系的分水岭。区内冲沟密布，故有“九十九溪”之称，水系呈典型的放射状向四周分流，其中属江口县境内主要有黑湾河、盘溪河、瓦溪河、马槽河、黄泥沟、廖家河、凯土河、牛尾河；属印江县境内的主要有肖家河、于家沟、淘金河；属松桃县境内的主要有鱼泉沟、乱石河，河流总长度超过200公里，以上河流年平均流量为12.37立方米/秒，且长年不断流。
梵净山是武陵山系西南段最高的山体，裸露着中晚元古宙的绿岩系，是中国南方晚前寒武地质研究的一个重要窗口。梵净山分布面积最多的是山地黄壤和暗黄棕壤，其土壤主要为森林土壤。成土母质为元古界板溪群变质岩风化的残积和坡积物。主要母岩有变余粉砂岩、变余石英砂岩、绢云母板岩、千枚岩、变余凝灰岩以及变质细碧角斑岩。