九间殿是九间硬山式的建筑，于明天启六年（1626）创建，为供奉五方如来佛的地方。北三间正中供有如来佛，塑像神态肃穆庄重。其他妙音天女、财源天女等塑像也神情自若，体态婀娜，形态各异，是塔尔寺中著名的彩塑作品。中三间供有文殊菩萨、观音菩萨和金刚渴塑菩萨像，造型优美。南三间正中供奉头戴黄帽的宗喀巴泥塑坐像，其旁边有一组头戴黄帽、红帽的喇嘛，描绘了格鲁派与宁玛派正在举行辩经会的情景。殿内还有一块粘满酥油，重达数百斤的大石头，相传上面有宗喀巴小时的手印和脚印。殿前的大院是喇嘛讲辩经典和法会跳法土舞的场所。
塔尔寺共有大小宝塔数十座，除大金瓦殿内的大银塔外，以由八个率堵波式塔一字排列组成在寺前的如意宝塔最为引人注目，它整齐、美观、雄伟。如意宝塔建于清乾隆四十一年（1776，八座塔的建筑形式基本相同，尖顶，上圆下方。每座塔下部为一方形高台，上部砌造须弥座，座上有五级层台，上置覆钵形塔身。塔身上接十三环相轮塔刹，刹顶端有宝盖、仰月、宝珠，为典型清代喇嘛塔。
如意宝塔是僧徒根据释迎牟尼一生重要经历和传说而建造，每一座塔代表佛陀的一件异行。八座塔纪念释迎牟尼的八件事是：一为莲花塔，纪念释迎牟尼初生时行7步，每步生莲花之意；二为四谛塔，纪念释迎牟尼初转FA轮，讲授四谛要义；三为和平塔，纪念释迎牟尼劝息僧众争论；四为菩萨塔，纪念释迎牟尼修行成正觉；五为神变塔，纪念释迎牟尼降伏外道的各种奇迹；六为降凡塔，纪念释迎牟尼重返人间超渡众生之说；七为胜利塔，纪念释迎牟尼战胜一切妖魔鬼怪：八为涅架塔，纪念释迎牟尼圆寂。在中国古塔中采用雕刻、绘画等形式表现释迎牟尼自降主到圆寂的八件大事的很多，而直接采用塔来反映“释迎八相”的却很少。印度曾有建八塔作为纪念的，但塔都分散各地，相距甚远。塔尔寺的如意宝塔却将代表释迎牟尼八件大事的八座宝塔集中排列在一起，实是一大创举。
过门塔建于清康熙五十年（1711），是过去进出塔尔寺必经的塔门。相传宗喀巴的母亲曾在这里下过帐房居住，因此，后人特修这座过门塔作为纪念，并为进出寺门的信徒在走过塔下时作顶礼佛迹之用。
过门塔为覆钵式，塔身全用青砖砌筑，采用砖雕制出斗拱、柱杭作为装饰，并刻有吨、嘛、呢、叭、咪、吟藏文六字真言。塔下部为一高大塔台，台间辟门以通行人，原为四门，后改为两门。这座塔是寺内的著名宝塔。
太平塔建子1942年，在寺内小金瓦殿前的广场上，是以象征太平而命名的。塔的特点是下部基座为一高层的方台，上部覆钵式塔身较小。塔刹十三天部分的收分较大，宝盖亦较瘦。太平塔虽建筑时间较晚，却是寺内众多的室塔中最高大的一座。
塔尔寺内还珍藏有天文、藏医、藏药、佛经和大量宝贵的文物，其中的酥油花、壁画和堆绣被誉为塔尔寺的兰绝，具有我国青藏地区的独特风格，有根高的艺术价值。酥油花有着悠久的历史，相传它的由来是唐朝文成公主入藏与赞普松赞干布联姻时，当地僧徒为表示尊敬，在文成公主从京城长安带去的一尊佛像前供奉了一柬酥油花，后来逐渐成为西藏人的习俗而传到塔尔寺。每年春节前酥油艺人使用酥油制作出许多塑像和图景，在农历正月十五口藏族人民的酥油花灯节上展出。这一年一度的盛会非常热闹，引人入胜。