中国地下水补给的分布地区也很广，除内蒙古、新疆部分干旱荒漠区的季节性河流及东南沿海丘陵区的季节性小河外，其它地区的河流均有地下水补给，而且不少河流是以地下水补给为主的。地下水补给虽然与该地区的降水量有一定的关系，但还与地质构造、下垫面情况及河床下切深度有密切关系，因此地下水补给的地区分布，不像雨水补给那样有较明显的规律性。例如，华北平原和黄土高原年降水量同样为500～600毫米，但华北平原上的河流宽而浅，地下水补给量不足10％。成为“悬河”的黄河下游，不仅完全得不到地下水补给，反而河水补给地下水。黄土高原上的河流，因黄土疏松，地下水丰富，河床下切又深，因此获得的地下水补给量可达50～60％，无定河的支流甚至高达80％以上。降水量多的东南沿海丘陵地区，因岩石透水性差，地下水贫乏，补给量不足10％，特别是下切较浅的小河，甚至全无地下水补给，成为降雨有水，雨停断流的暂时性河流。广西、云南、贵州及湖南西部的大片石灰岩分布区，地表多漏斗，地下多溶洞伏流，地下水补给极为丰富。青藏高原上，因有大量冰川堆积物，松散多孔隙，地下水丰富，补给量可达50～60％。中国西北内陆山地，因经历过多次地质构造运动，岩石破碎，节理发育，蓄存着丰富的地下水，有些河流获得的地下水补给亦可达60％以上。
地下水的补给缓慢而稳定，补给河流的绝对量随季节变化不大，但在河水中所占比重的变化较大。因夏半年的雨水和冰雪融水很多，相比之下地下水所占比重较小；而在冬季，其它形式的补给水量大减，地下水补给比重相对增大，甚至成为主要水源。