麦哲伦对叛乱早有准备。局势虽然极其严重，但他镇定自如，毫不慌乱。他不会把自己送上门束手就擒。他知道自己的旗舰把在港湾口上，叛乱分子一个也逃不走。特别使他镇定的是，他了解大多数船员是通情达理的。
麦哲伦与来旗舰送最后通牒的人说：“好，让我考虑一下。你们等一等。”
麦哲伦使用缓兵之计稳住送信人，与此同时，他对保安官埃斯比诺沙说：“你迅速带领六名武装水手，乘坐小船到维多利亚号。把我致船长缅多萨的信交给他。在他看信的时候，除掉他。要干得干脆利落！”
“是。”埃斯比诺沙按麦哲伦的吩咐迅速乘船登上了维多利亚号。他对船长缅多萨说：“总领队麦哲伦先生有信给您，请看。”缅多萨不知是计，接过信阅读，说时迟，那时快，埃斯比诺沙乘其不备，抽出短剑，一剑刺死了缅多萨。与此同时，麦哲伦又对他的内弟杜亚脱·巴尔波查说：“你率领15名武装弟兄，迅速乘小船前往维多利亚号，在缅多萨被处决之后，立即将船开到旗舰旁边。”
功夫不大，小巴尔波查果真将船开了过来。这样，在港湾口上一列排开了三艘船：旗舰特里尼达号、圣地亚哥号、维多利亚号。
他们封锁了出海口。
第二天凌晨，圣安东尼奥号和康塞普逊号企图逃走，被麦哲伦发觉了。他命令三艘船舰向叛乱分子开炮。
轰隆——轰隆——一颗颗炮弹飞向叛变的两艘船舰。在猛烈的炮火下，两艘船上的多数海员表示拥护麦哲伦，扣押了卡尔塔海纳和凯萨达。
叛乱被平定了。麦哲伦处死了凯萨达。之后，将卡尔塔海纳与一个心怀不满的神父流放到一个名叫巴塔哥尼亚的地方。
战胜了叛乱，战胜了寒冬，人们越来越佩服麦哲伦的英勇和坚强。春回大地，万物更新，草绿了，花开了，船队海员们个个心花怒放。人们掐指一算，在这南半球度过了5个月的冬季。
1520年8月24日，船队重整旗鼓，从圣胡刮安港湾出发，继续向南航行。又走了将近两个月，在南纬52度的海岸，发现一个海口。派去勘察的人，带回一个让人惊讶的消息。他们说进入海口，水一直是咸的，没有遇到淡水（从陆地流入海洋的水是淡水），而且水流很急。麦哲伦听后一拍双手，大声说：“太好了！我们找到海峡了。通过海峡，我们就可以进入大南海！”
他的判断并不错。这是一条海峡，东边通南大西洋，西边通南太平洋，长约580公里。后来命名它为麦哲伦海峡。
就在麦哲伦兴奋地率船队在海峡中摸索前进时，被派去探航的圣安东尼奥号上的主舵手哥米什看到海峡浪高风大，加之对前途信心不足的仇恨麦哲伦，纠集了一些人扣押了船长麦斯基塔，掉转船头返回了西班牙。
来时的五只船，圣地亚哥号遇难沉没，现在又走了一只，乘下三艘船，在麦哲伦的指挥下继续前进。28天以后，也就是1520年11月28日，在他们面前突然出现了一片浩瀚的海面，他们真的来到了大南海！
驶出麦哲伦海峡，舰队向西北方向行进。一个奇迹出现了，3个多月的航行，竟然没有遇到一次大风浪，海面平静极了。所有的人都说：“这真是一个太平的海洋！”
从此，太平洋，这个名称就沿袭使用下来，成了这个大洋的名称。其实，